Cerrahi prosedür, pankreas içindeki IPMN'nin pankreas konumuna bağlı olarak değişecektir. Pankreasın kuyruğundaki bir IPMN, distal pankreatektomi adı verilen cerrahi bir prosedürle tedavi edilir. Pankreasın başında bulunan bir IPMN, bir pankreatikoduodenektomi veya Whipple prosedürü ile tedavi edilir. Nadir durumlarda, total pankreatektomi adı verilen bir prosedürde IPMN'li hastalarda tüm pankreas kaldırılır. .

Duktal dallar içinde keşfedilen IPMN'lerin tedavi edilmesi daha zordur ve cerrahi yerine, çoğu kez, görüntüleme bulguları için görüntüleme bulguları ile yakından izlenir. Bu yandal kanal tipi IPMN'ler, ana kanal IPMN'lerinden daha az saldırgan olma çalışmalarında bulunmuştur.

Tecrübeli pankreas cerrahları pankreas hastalıklarını ve bozukluklarını tedavi etmek için laparoskopi gibi bir tür endoscopik prosedür gibi minimal invaziv cerrahi teknikleri kullanmaktadır. Laparoskopik pankreas cerrahisi tarafımızca da sık olarak tercih edilen bir yöntemdir.